神兽和稀有精灵的分布位置是玩家关注的重点。火焰鸟位于七子岛中一岛火山顶，闪电鸟在无人发电厂内部深处，急冻鸟则需要前往双子岛，通过推石头堵住瀑布后才能在最深处遇到。超梦的捕捉地点位于通关后新增的那达洞穴深处，而梦幻则出现在遗忘岛。代欧奇希斯在华蓝洞，烈空座同样在华蓝洞内，固拉多位于6岛遗迹谷草地，盖欧卡需在双子岛外用超级钓竿捕获。
雪拉比出现在2号岛天涯海角，炎帝需前往红莲岛精灵小屋地下室，水君在20号水道使用低级钓竿才有机会遇到，雷公则栖息于无人发电厂。三圣柱的分布也各有不同，雷吉洛克位于斗士之路，雷吉艾斯在4岛阴森洞穴最深处，雷吉斯奇鲁则再次回到无人发电厂区域。凤凰的捕捉地点在真新镇下方的草地，洛基亚则需前往7号岛战斗塔下方的草丛。
野生原野区是大量捕获普通精灵的重要地点，规则限定玩家只能使用提供的野生球，并依据步数限制活动范围。该区域深处藏有金假牙，交还给特定NPC后可获得秘传机HM03冲浪。超级鱼竿在此区域能钓到迷你龙，尽管几率较低。捕捉策略上，丢石头可提高成功率，但也会增加目标逃跑概率，需谨慎权衡。
其他值得注意的精灵包括佐罗亚克，其在20号道路的草丛中极难遇到，需耐心反复尝试。华蓝洞内除超梦外，冰神柱也可能出现，但需满足特定条件。火焰山不仅是火系精灵聚集地，山顶固定刷新火焰鸟。合理利用极限球、睡眠粉等道具可提升捕捉效率，状态技能如麻痹粉能有效降低目标逃跑风险。
游戏中的精灵分布与捕捉机制设计紧密关联地形与剧情推进。部分神兽需通关后解锁，而如三圣鸟的刷新则与初始选择的御三家属性相关。玩家需结合地图探索与技能运用，逐步完成全图鉴收集目标。
